我想使用IPython笔记本作为交互式分析我使用BiopythonGenomeDiagram模块制作的一些基因组图的方法。尽管有大量有关如何matplotlib在IPython笔记本中使用内联图形的文档,但GenomeDiagram使用ReportLab工具箱,我认为IPython不支持内联图形。
GenomeDiagram
matplotlib
但是,我当时想,一种解决方法是将绘图/基因组图写到文件中,然后打开图像内联图像,结果将是相同的,如下所示:
gd_diagram.write("test.png", "PNG") display(file="test.png")
但是,我不知道该怎么做-或知道是否可能。有人知道是否可以在IPython中打开/显示图像吗?
通过此帖子,您可以执行以下操作:
from IPython.display import Image Image(filename='test.png')
(官方文档)