一尘不染

在R中导入python模块

python

我正在尝试使用该reticulate软件包在R中导入python模块。该模块可以在这里找到。我克隆了存储库并python setup.py install运行成功。如果打开python
shell,则可以导入debot。但是,当我尝试将其导入RStudio时,出现以下错误:

dbot=import("debot")
Error in py_module_import(module, convert = convert) : 
  ImportError: No module named debot

我在macOS Sierra版本10.12.6上并通过Anaconda安装了python 3.6。我也尝试过给出python的路径为:

path_to_python <- "/anaconda/bin/python3.6"
use_python(path_to_python)

当我从终端运行python时,我得到:

Python 3.6.1 |Anaconda 4.4.0 (x86_64)| (default, May 11 2017, 13:04:09) 
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.57)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

不确定python的路径是否正确。

好的,做了一些进一步的挖掘,发现它reticulate仍然指向我的旧版本python
2.7的python路径,这是Macbook的默认路径。当我跑步时py_config(),我得到的是:

python:         /usr/bin/python
libpython:      /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/config/libpython2.7.dylib
pythonhome:     /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7:/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7
version:        2.7.10 (default, Feb  7 2017, 00:08:15)  [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 8.0.0 (clang-800.0.34)]

无论我尝试什么,都无法reticulate使用该use_python()功能查看安装模块的正确路径。我确实认为这是一个问题reticulate。有什么想法我下一步应该做什么?


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2021-01-20

共1个答案

一尘不染

看完这篇文章,我终于明白了。我认为在从reticulate包中调用任何其他函数之前,必须指定要使用的python的路径。因此,我现在要遵循的顺序是:

library(reticulate)
path_to_python <- "/anaconda/bin/python"
use_python(path_to_python)
2021-01-20