一尘不染

为什么collections.Counter比''.count要慢得多?”

python

我有一个简单的任务:计算每个字母在一个字符串中出现的次数。我已经使用了Counter()它,但是在一个论坛上我看到了使用dict()/Counter()string.count()每个字母都要慢得多的信息。我认为它只能在字符串中进行一次string.count()遍历,而解决方案则必须遍历该字符串四次(在这种情况下)。为什么Counter()这么慢?

>>> timeit.timeit('x.count("A");x.count("G");x.count("C");x.count("T")', setup="x='GAAAAAGTCGTAGGGTTCCTTCACTCGAGGAATGCTGCGACAGTAAAGGAGGCCACGTGGTTGAGAGTTCCTAAGCATTCGTATGTACACCCGGACTCGATGCACTCAAACGTGCTTAAGGGTAAAGAAGGTCGAGAGGTATACTGGGGCACTCCCCTTAGAATTATATCTTGGTCAACTACAATATGGATGGAAATTCTAAGCCGAAAACGACCCGCTAGCGGATTGTGTATGTATCACAACGGTTTCGGTTCATACGCAAAATCATCCCATTTCAAGGCCACTCAAGGACATGACGCCGTGCAACTCCGAGGACATCCCTCAGCGATTGATGCAACCTGGTCATCTAATAATCCTTAGAACGGATGTGCCCTCTACTGGGAGAGCCGGCTAGACTGGCATCTCGCGTTGTTCGTACGAGCTCCGGGCGCCCGGGCGGTGTACGTTGATGTACAGCCTAAGAGCTTTCCACCTATGCTACGAACTAATTTCCCGTCCATCGTTCCTCGGACTGAGGTCAAAGTAACCCGGAAGTACATGGATCAGATACACTCACAGTCCCCTTTAATGACTGAGCTGGACGCTATTGATTGCTTTATAAGTGTTATGGTGAACTCGAAGACTTAGCTAGGAATTTCGCTATACCCGGGTAATGAGCTTAATACCTCACAGCATGTACGCTCTGAATATATGTAGCGATGCTAGCGGAACGTAAGCGTGAGCGTTATGCAGGGCTCCGCACCTCGTGGCCACTCGCCCAATGCCCGAGTTTTTGAGCAATGCCATGCCCTCCAGGTGAAGCGTGCTGAATATGTTCCGCCTCCGCACACCTACCCTACGGGCCTTACGCCATAGCTGAGGATACGCGAGTTGGTTAGCGATTACGTCATTCCAGGTGGTCGTTC'", number=10000)
0.07911698750407936
>>> timeit.timeit('Counter(x)', setup="from collections import Counter;x='GAAAAAGTCGTAGGGTTCCTTCACTCGAGGAATGCTGCGACAGTAAAGGAGGCCACGTGGTTGAGAGTTCCTAAGCATTCGTATGTACACCCGGACTCGATGCACTCAAACGTGCTTAAGGGTAAAGAAGGTCGAGAGGTATACTGGGGCACTCCCCTTAGAATTATATCTTGGTCAACTACAATATGGATGGAAATTCTAAGCCGAAAACGACCCGCTAGCGGATTGTGTATGTATCACAACGGTTTCGGTTCATACGCAAAATCATCCCATTTCAAGGCCACTCAAGGACATGACGCCGTGCAACTCCGAGGACATCCCTCAGCGATTGATGCAACCTGGTCATCTAATAATCCTTAGAACGGATGTGCCCTCTACTGGGAGAGCCGGCTAGACTGGCATCTCGCGTTGTTCGTACGAGCTCCGGGCGCCCGGGCGGTGTACGTTGATGTACAGCCTAAGAGCTTTCCACCTATGCTACGAACTAATTTCCCGTCCATCGTTCCTCGGACTGAGGTCAAAGTAACCCGGAAGTACATGGATCAGATACACTCACAGTCCCCTTTAATGACTGAGCTGGACGCTATTGATTGCTTTATAAGTGTTATGGTGAACTCGAAGACTTAGCTAGGAATTTCGCTATACCCGGGTAATGAGCTTAATACCTCACAGCATGTACGCTCTGAATATATGTAGCGATGCTAGCGGAACGTAAGCGTGAGCGTTATGCAGGGCTCCGCACCTCGTGGCCACTCGCCCAATGCCCGAGTTTTTGAGCAATGCCATGCCCTCCAGGTGAAGCGTGCTGAATATGTTCCGCCTCCGCACACCTACCCTACGGGCCTTACGCCATAGCTGAGGATACGCGAGTTGGTTAGCGATTACGTCATTCCAGGTGGTCGTTC'", number=10000)
2.1727447831030844
>>> 2.1727447831030844 / 0.07911698750407936
27.462430656767047
>>>

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2021-01-20

共1个答案

一尘不染

Counter()允许您计算任何可哈希对象,而不仅仅是子字符串。两种解决方案都是O(n)-time。您的测量结果表明,迭代和散列单个字符的开销Counter()大于运行s.count()4倍。

Counter() 可以 使用C
helper来计算元素,但似乎不是特殊情况的字符串,并且使用适用于任何其他可迭代项的通用算法,即,处理单个字符涉及多个Python C
API调用以推进迭代器,获取先前的值(在哈希表),增量计数器,设置新值(哈希表中的查找)

    while (1) {
        key = PyIter_Next(it);
        if (key == NULL)
            break;
        oldval = PyObject_GetItem(mapping, key);
        if (oldval == NULL) {
            if (!PyErr_Occurred() || !PyErr_ExceptionMatches(PyExc_KeyError))
                break;
            PyErr_Clear();
            Py_INCREF(one);
            newval = one;
        } else {
            newval = PyNumber_Add(oldval, one);
            Py_DECREF(oldval);
            if (newval == NULL)
                break;
        }
        if (PyObject_SetItem(mapping, key, newval) == -1)
            break;
        Py_CLEAR(newval);
        Py_DECREF(key);
    }

将其与FASTSEARCH()字节字符串的开销进行比较:

    for (i = 0; i < n; i++)
        if (s[i] == p[0]) {
           count++;
           if (count == maxcount)
              return maxcount;
        }
    return count;
2021-01-20