这取决于您的搜索方式。

如果您这样搜索：

/* Given a value from table1, find all related values from table2 */
SELECT *
FROM table1 t1
JOIN table_table tt ON (tt.table_1 = t1.id)
JOIN table2 t2 ON (t2.id = tt.table_2)
WHERE t1.id = @id

那么您需要：

ALTER TABLE table_table ADD CONSTRAINT pk_table1_table2 (table_1, table_2)

在这种情况下，table1将被引入，NESTED LOOPS并且只有在table1首先建立索引时，您的索引才可用。

如果您这样搜索：

/* Given a value from table2, find all related values from table1 */
SELECT *
FROM table2 t2
JOIN table_table tt ON (tt.table_2 = t2.id)
JOIN table1 t1 ON (t1.id = tt.table_1)
WHERE t2.id = @id

那么您需要：

ALTER TABLE table_table ADD CONSTRAINT pk_table1_table2 (table_2, table_1)

由于上述原因。

您在这里不需要独立的索引。复合索引可以在可以使用第一列的纯索引的任何地方使用。如果使用独立索引，则将无法有效搜索这两个值：

/* Check if relationship exists between two given values */
SELECT 1
FROM table_table
WHERE table_1 = @id1
  AND table_2 = @id2

对于这样的查询，两列都至少需要一个索引。

为第二个字段添加一个附加索引从不坏：

ALTER TABLE table_table ADD CONSTRAINT pk_table1_table2 PRIMARY KEY (table_1, table_2)
CREATE INDEX ix_table2 ON table_table (table_2)

主键将用于搜索on both values和基于值的搜索table_1，附加索引将用于基于值的搜索table_2。