对于 Anaconda Navigator 桌面应用程序消失的问题，下载 32 位版本的 Anaconda 也不应该是导致问题的原因。在 64 位操作系统上，32 位版本的 Anaconda 也可以正常安装和运行。

以下是解决此问题的一些建议：

1. 搜索 Anaconda Navigator: 即使桌面上或“开始”菜单中没有 Anaconda Navigator 的图标，你仍然可以尝试在任务栏中的搜索栏中直接搜索 Anaconda Navigator。有时，应用程序仍然可以通过这种方式安装和访问。

2. 检查安装目录: 转到 Anaconda 安装的目录（通常是 C:\Users\YourUsername\Anaconda3 或类似的位置）。在 Anaconda 目录中查找 Scripts 文件夹。在这里，你应该找到 anaconda-navigator.exe 文件。你可以在桌面上创建该文件的快捷方式，或者将其固定到“开始”菜单中。

3. 重新安装 Anaconda: 由于你提到下载了两次 Anaconda，可能安装过程中出现了问题。你可以尝试重新安装 Anaconda 看看是否解决了问题。请确保仔细遵循安装说明。

4. 检查安装过程中是否有错误: 如果在安装过程中出现了任何错误或警告，可能表示安装过程中出现了问题。查看安装日志中是否有任何错误消息，或者尝试以管理员权限重新安装 Anaconda。

5. 联系 Anaconda 支持: 如果仍然无法解决问题，你可以联系 Anaconda 支持寻求帮助。他们可能能够提供进一步的指导或与你一起排除问题。

通过遵循这些步骤，你应该能够解决 Anaconda Navigator 桌面应用程序消失的问题。