这个错误通常是由加载多个不同版本的 Protobuf 库或重复加载同一版本的 Protobuf 库引起的。当 Protobuf 库尝试注册同一个文件描述符（如 google/protobuf/descriptor.proto）多次时，就会发生这个错误。

以下是一些解决此问题的方法：

方法 1：检查和更新 Protobuf 版本

确保你的项目中所有依赖项使用的 Protobuf 版本是一致的。不同版本之间的冲突是常见的原因之一。

1. 更新所有依赖项：检查你的项目及其所有依赖项使用的 Protobuf 版本。如果版本不一致，尝试更新它们使其一致。
2. 重新编译：重新编译所有依赖项，以确保它们使用相同版本的 Protobuf。

方法 2：检查动态库加载

如果你在使用动态库（如 .so 文件），确保在运行时没有重复加载多个版本的 Protobuf 动态库。

1. 动态库路径：检查 LD_LIBRARY_PATH 环境变量，确保它指向正确的 Protobuf 库路径。
2. 静态链接：如果可能，尝试将 Protobuf 静态链接到你的应用程序中，避免动态库版本冲突。

方法 3：避免重复初始化 Protobuf

确保 Protobuf 库只初始化一次。如果在多个地方初始化 Protobuf，可能会导致文件描述符重复注册。

方法 4：清理和重新构建

有时，构建过程中的缓存或临时文件可能会导致问题。尝试清理和重新构建你的项目。

1. 清理构建目录：
   sh make clean
2. 重新生成构建文件：
   sh cmake .
3. 重新编译：
   sh make

方法 5：检查和修改代码

如果你的项目包含多个模块或插件，确保所有模块在初始化 Protobuf 时不会重复注册文件描述符。

#include <google/protobuf/stubs/common.h>

int main(int argc, char* argv[]) {
    GOOGLE_PROTOBUF_VERIFY_VERSION;

    // Your code here

    google::protobuf::ShutdownProtobufLibrary();
    return 0;
}

确保 GOOGLE_PROTOBUF_VERIFY_VERSION 只调用一次，并在程序结束时调用 ShutdownProtobufLibrary()。

示例解决方案

假设你在使用动态库，可以尝试如下方法确保动态库路径正确：

1. 检查 LD_LIBRARY_PATH：

   sh echo $LD_LIBRARY_PATH

2. 设置正确的动态库路径：

   sh export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/correct/protobuf/lib:$LD_LIBRARY_PATH

3. 运行程序：

   sh ./your_program

如果上述方法仍未解决问题，请检查以下几点：

1. 依赖冲突：确保所有依赖项使用的是同一版本的 Protobuf 库。
2. 重复加载：确认没有重复加载 Protobuf 库。
3. 清理缓存：清理构建缓存和临时文件，重新编译所有依赖项。

通过这些步骤，应该能解决 File already exists in database 错误。如果问题仍然存在，可以提供更多的上下文或错误日志，以便进一步诊断。