我认为两者之间的区别归结为访问。系统环境变量可以由任何进程访问，而Java系统属性只能由添加到它们的进程访问。

另外，正如Bohemian所说，env变量是在OS中设置的（但是可以通过Java设置），而系统属性则作为命令行选项传递或通过设置setProperty()。

使用-Dpropertyname=value语法在Java命令行上设置系统属性。也可以使用System.setProperty(String key, String value)或通过各种 System.getProperties().load()方法在运行时添加它们。
要获取特定的系统属性，可以使用System.getProperty(String key)或System.getProperty(String key, String def)。

环境变量是在OS（例如Linuxexport HOME=/Users/myusername或WindowsSET WINDIR=C:\Windows等）中设置的，与属性不同，环境变量可能无法在运行时设置。
要获取特定的环境变量，可以使用System.getenv(String name)。